Les organes de conseil du FOFIFA comprennent :
– le Conseil d’Administration est investi des pouvoirs les plus étendus pour administrer le FOFIFA et agir en son nom, et pour faire autoriser tous les actes ou opérations relatifs à son objet.
Le Conseil d’Administration se réunit au moins deux fois par an, à la demande de son Président ou celle du Directeur Général ou encore à celle de la majorité des membres.
– le Conseil Scientifique d’Orientation est chargé de l’évaluation scientifique des résultats, et de l’instruction technique des projets à présenter au Conseil d’Administration;
Il est présidé par le Ministre chargé de la Recherche Scientifique, représenté par le Directeur Général de la Recherche Scientifique.
– La Direction Générale est l’organe exécutif du FOFIFA, elle comprend :
– la Direction Scientifique ;
– La Direction Administrative et Financière; et
– La Direction de gestion et de valorisation du patrimoine.